Деятельность Фонда развивается в сферах культуры, просвещения и гуманитарных наук. Все программы Фонда тесно связаны с научным и общественным наследием Дмитрия Сергеевича Лихачева. Сохранение памятников культуры, развитие краеведения, в том числе петербурговедения, изучение русского зарубежья, охрана исторических кладбищ, история и возрождение российской благотворительности — вот круг вопросов, волнующих Фонд. Часть проектов Фонд осуществляет самостоятельно — силами своих сотрудников и экспертов, часть проектов осуществляется партнерскими организациями при финансовой поддержки Фонда. В рамках долгосрочных программ Фонд проводит грантовые конкурсы, учреждает премии и стипендии.